گروه بندی جدایه های ویروس موزاییک خیار (cucumber mosaic virus) در منطقه مرکزی ایران بر اساس توالی ژن پروتئین پوششی

thesis
abstract

جنس cucumovirus یکی از اعضای خانواده bromoviridae می باشد و سه عضو ویروس موزاییک خیار، ویروس کوتولگی بادام زمینی و ویروس بی بذری گوجه فرنگی را شامل می شود.جدایه های ویروس موزاییک خیار بر اساس روش های سرولوژیک، نقشه پپتیدی پروتئین پوششی و تشابه ژنومی rna های ویروس گروه بندی می گردند. روش های مبتنی بر pcr نسبت به روش های سرولوژیک دارای حساسیت بیشتری هستند. جدایه های ویروس موزاییک خیار بر اساس ژن ناحیه پروتئین پوششی و ناحیه غیر کد شونده انتهای ژن در دو زیرگروه اصلی i و ii گروه بندی می شوند. حدود 140 نمونه با علایم ویروس موزاییک خیار از مناطق مختلف استان های اصفهان، چهار محال و بختیاری و مرکزی انجام گرفت. پس از استخراج rna کل از نمونه های آلوده به cmv، آزمون rt-pcr با جفت آغازگر تکثیر کننده ناحیه ژن پروتئین پوششی و ناحیه غیر کد شونده انتهای ژن rna3 انجام گرفت و قطعه ی 940 جفت بازی تکثیر گردید. نواحی توالی یابی شده در تمامی جدایه های این تحقیق شامل ناحیه ی ژن پروتئین پوششی با 657 جفت باز بود که توانایی کد کردن 218 آمینواسید را دارا می باشد. نتایج حاصل از همردیف سازی توالی های حاصل از این تحقیق با توالی های موجود در بانک ژن نشان داد که تمامی جدایه های این تحقیق (به جز جدایه ماش دستگرد اسفرزه (kf873621)) با درصد تشابه 94 تا 99% تشابه در زیرگروه ia و همراه با جدایه های so، bn57، mgh91، vir، ei1، di1 و gi1 قرار گرفتند. جدایه mde (ماش دستگرد اسفرزه) با 91 تا 92 درصد تشابه همراه با جدایه های zmbj و nt9 در زیرگروه ib قرار گرفتند. در درخت فیلونی رسم شده نیز تمامی جدایه های این تحقیق در زیرگروه i ویروس موزاییک خیار قرار گرفتند. نتایج این تحقیق نشان داد که اعضای زیرگروه ia و ib روی گیاهان میزبان در ناحیه مرکزی ایران وجود دارند و این در حالی است که اعضای زیرگروه ia فراوانی بیشتری دارند و جدایه های کمی تا کنون از زیر گروه ib و ii از ایران گزارش گردیده است.

similar resources

حذف ویروس موزاییک خیار (cucumber mosaic virus, cmv) از گلایل

ویروس موزاییک خیار از رایج‎ترین ویروس‎های گلایل در سراسر جهان است. تکثیر گلایل از طریق اندام رویشی پداژه است بنابراین بیماری‎های ویروسی در آن از نسلی به نسل بعد منتقل و سبب افزایش بیماری و کاهش کیفیت آن می‎شود. بنابراین تولید پداژه‎های سالم از اهمیت زیادی برخوردار است. در این تحقیق درصد آلودگی پداژه‎های گلایل موجود در بازار به ویروس موزاییک خیار در دو استان تهران و البرز تعیین شد و روش گرمادرما...

شناسایی مولکولی ستلایت آران‌ای غیر نکروزی ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus

ستلایت آران‌ای در برخی جدایه های ویروس موزاییک خیارCucumber mosaic virus, (CMV) سبب کاهش یا تشدید علائم این ویروس می‌شود. جهت بررسی وجود ستلایت آران-ای‌، نمونه‌های آلوده گیاهی مشکوک به CMV از میزبان‌های مختلف جمع‌آوری شدند. ابتدا با استفاده از روشهای سرولوژیک مانند DAS-ELISA و دیبا CMV ردیابی شد. به منظور بررسی بیشتر علائم و اثر احتمالی ستلایت آران‌ای بر روی علائم، آزمون تک لکه گیری با استفاده ...

full text

شناسایی مولکولی و تجزیه¬تحلیل تبارزایی ویروس موزاییک خیار زیرگروه IB جداشده از گیاه دارویی ختمی

ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) ، از جنس Cucumovirus و خانواده Bromoviridae می­باشد. خَتمی (Althaea officinalis) گیاهی یک­ساله و خودرو از تیره پنیرکیان است که گل، میوه و ریشه آن مصارف دارویی دارد. در این تحقیق، پنج نمونه مشکوک به آلودگی با CMV از گیاه ختمی جمع­آوری و وجود CMV با آزمون­های سرولوژیکی از جمله DAS-ELISA ، از نمونه­ها ردیابی شد. از بین آن­ها، جدایه Ta-alth انتخاب و پس ...

full text

بررسی توالی ژن پروتئین پوششی جدایه‌های ایرانی ویروس ایکس هوستا

در بهار سال 1390 طی بازدیدی از مراکز تولید گیاهان زینتی در شهرستان‌های کرج و تنکابن، تعدادی بوته هوستا (Hosta sieboldiana.) با علائم موزائیک، پیسک و بدشکلی برگ‌ها مشاهده شد. تعداد 17 بوته علائم‌دار انتخاب شد و احتمال آلودگی آنها به ویروس‌های موزائیک آرابیس (Arabis mosaic virus-ArMV)، موزائیک خیار (Cucumber mosaic virus-CMV)، پژمردگی لکه‌ای گوجه‌فرنگی (Tomato spotted wilt virus-TSWV)، لکه نکروز ...

full text

تعیین فراوانی، خصوصیات بیولوژیکی و جایگاه تبارزایی جدایه های ویروس A سیب زمینی بر اساس توالی ژن پروتئین پوششی در دو استان خراسان رضوی و مرکزی

و ویروس A سیب‌زمینی (PVA) از جمله ویروس­های مهم خسارت‌زا در سیب‌زمینی می­باشد. در بهار وتابستان 1389، تعددا 280 و463 نمونه برگی به‌ترتیب علائم‌دار و تصادفی و نیز تعداد 1336 غده از مزارع سیب‌زمینی استان­های خراسان رضوی و مرکزی جمع­آوری وکل نمونه­ها با استفاده از آزمون الایزا از نظر آلودگی به ویروس PVA مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصل بیانگر گسترش آلودگی به این ویروس در 39 و 10 درصد نمونه­های ع...

full text

تعیین فراوانی، خصوصیات بیولوژیکی و جایگاه تبارزایی جدایه های ویروس A سیب زمینی بر اساس توالی ژن پروتئین پوششی در دو استان خراسان رضوی و مرکزی

و ویروس A سیب‌زمینی (PVA) از جمله ویروس­های مهم خسارت‌زا در سیب‌زمینی می­باشد. در بهار وتابستان 1389، تعددا 280 و463 نمونه برگی به‌ترتیب علائم‌دار و تصادفی و نیز تعداد 1336 غده از مزارع سیب‌زمینی استان­های خراسان رضوی و مرکزی جمع­آوری وکل نمونه­ها با استفاده از آزمون الایزا از نظر آلودگی به ویروس PVA مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصل بیانگر گسترش آلودگی به این ویروس در 39 و 10 درصد نمونه­های ع...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


document type: thesis

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهرکرد - دانشکده کشاورزی

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023